Als Erzabt steht Jakob Auer OSB der benediktinischen Gemeinschaft von St. Peter vor, die das geistliche und kulturelle Leben Salzburgs seit Jahrhunderten mitprägt. Mit seinem Amt ist auch die Mitgliedschaft im Präsidium der Salzburger Äbtekonferenz verbunden. Bei der Salzburger Adventmusik im Abteisaal von St. Peter und beim Seitenstettner Adventsingen 2026 übernimmt er die Lesung der Texte und verbindet das musikalische Programm des Ensembles Péridot Salzburg mit dem gesprochenen Wort.